Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U3KQA8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U3KQA8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
U3KQA8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U3KQA8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U3KQA8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U3KQA8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U3KQA8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
U3KQA8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U3KQA8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U3KQA8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
U3KQA8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U3KQA8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
U3KQA8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U3KQA8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U3KQA8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U3KQA8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
U3KQA8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
U3KQA8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
U3KQA8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U3KQA8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U3KQA8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U3KQA8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U3KQA8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U3KQA8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
U3KQA8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U3KQA8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U3KQA8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
U3KQA8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U3KQA8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U3KQA8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U3KQA8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U3KQA8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
U3KQA8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U3KQA8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
U3KQA8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U3KQA8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
U3KQA8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U3KQA8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U3KQA8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U3KQA8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
U3KQA8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U3KQA8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U3KQA8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U3KQA8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
U3KQA8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U3KQA8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U3KQA8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
U3KQA8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
U3KQA8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
U3KQA8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U3KQA8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U3KQA8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U3KQA8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
U3KQA8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
U3KQA8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U3KQA8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
U3KQA8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
U3KQA8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
U3KQA8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U3KQA8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
U3KQA8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
U3KQA8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U3KQA8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U3KQA8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U3KQA8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U3KQA8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U3KQA8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U3KQA8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U3KQA8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
U3KQA8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
U3KQA8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
U3KQA8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
U3KQA8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U3KQA8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U3KQA8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U3KQA8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U3KQA8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U3KQA8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U3KQA8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U3KQA8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U3KQA8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
U3KQA8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U3KQA8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U3KQA8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U3KQA8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U3KQA8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQA8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQA8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQA8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQA8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQA8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQA8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQA8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQA8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQA8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQA8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQA8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQA8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U3KQA8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms