Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SETBP1Q9Y6X0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SETBP1Q9Y6X0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SETBP1Q9Y6X0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SETBP1Q9Y6X0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SETBP1Q9Y6X0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SETBP1Q9Y6X0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SETBP1Q9Y6X0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SETBP1Q9Y6X0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SETBP1Q9Y6X0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SETBP1Q9Y6X0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SETBP1Q9Y6X0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SETBP1Q9Y6X0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SETBP1Q9Y6X0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SETBP1Q9Y6X0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SETBP1Q9Y6X0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SETBP1Q9Y6X0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SETBP1Q9Y6X0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SETBP1Q9Y6X0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SETBP1Q9Y6X0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SETBP1Q9Y6X0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
SETBP1Q9Y6X0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
SETBP1Q9Y6X0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SETBP1Q9Y6X0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SETBP1Q9Y6X0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SETBP1Q9Y6X0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SETBP1Q9Y6X0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SETBP1Q9Y6X0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SETBP1Q9Y6X0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SETBP1Q9Y6X0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SETBP1Q9Y6X0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SETBP1Q9Y6X0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SETBP1Q9Y6X0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SETBP1Q9Y6X0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SETBP1Q9Y6X0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SETBP1Q9Y6X0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SETBP1Q9Y6X0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SETBP1Q9Y6X0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SETBP1Q9Y6X0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
SETBP1Q9Y6X0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SETBP1Q9Y6X0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SETBP1Q9Y6X0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SETBP1Q9Y6X0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SETBP1Q9Y6X0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SETBP1Q9Y6X0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SETBP1Q9Y6X0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SETBP1Q9Y6X0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SETBP1Q9Y6X0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SETBP1Q9Y6X0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SETBP1Q9Y6X0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SETBP1Q9Y6X0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
SETBP1Q9Y6X0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SETBP1Q9Y6X0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SETBP1Q9Y6X0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms