Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYVE1Q9Y5Y7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LYVE1Q9Y5Y7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYVE1Q9Y5Y7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYVE1Q9Y5Y7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms