Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD3Q9Y597 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD3Q9Y597 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD3Q9Y597 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD3Q9Y597 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD3Q9Y597 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCTD3Q9Y597 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCTD3Q9Y597 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD3Q9Y597 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD3Q9Y597 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD3Q9Y597 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD3Q9Y597 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD3Q9Y597 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCTD3Q9Y597 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCTD3Q9Y597 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCTD3Q9Y597 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCTD3Q9Y597 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCTD3Q9Y597 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCTD3Q9Y597 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCTD3Q9Y597 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCTD3Q9Y597 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms