Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXND1Q9Y4D7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXND1Q9Y4D7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXND1Q9Y4D7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXND1Q9Y4D7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXND1Q9Y4D7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXND1Q9Y4D7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXND1Q9Y4D7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXND1Q9Y4D7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXND1Q9Y4D7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXND1Q9Y4D7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXND1Q9Y4D7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXND1Q9Y4D7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXND1Q9Y4D7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXND1Q9Y4D7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXND1Q9Y4D7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXND1Q9Y4D7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXND1Q9Y4D7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXND1Q9Y4D7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXND1Q9Y4D7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXND1Q9Y4D7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms