Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPS28Q9Y2Q9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MRPS28Q9Y2Q9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPS28Q9Y2Q9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPS28Q9Y2Q9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPS28Q9Y2Q9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPS28Q9Y2Q9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPS28Q9Y2Q9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPS28Q9Y2Q9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPS28Q9Y2Q9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPS28Q9Y2Q9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPS28Q9Y2Q9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPS28Q9Y2Q9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPS28Q9Y2Q9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPS28Q9Y2Q9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPS28Q9Y2Q9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPS28Q9Y2Q9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms