Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8A1Q9Y2Q0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8A1Q9Y2Q0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8A1Q9Y2Q0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms