Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP20Q9Y2K6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP20Q9Y2K6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP20Q9Y2K6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP20Q9Y2K6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP20Q9Y2K6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP20Q9Y2K6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP20Q9Y2K6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP20Q9Y2K6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP20Q9Y2K6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP20Q9Y2K6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP20Q9Y2K6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP20Q9Y2K6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP20Q9Y2K6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP20Q9Y2K6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP20Q9Y2K6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP20Q9Y2K6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP20Q9Y2K6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP20Q9Y2K6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms