Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC59.74■■■■■ 7.15
NISCHQ9Y2I1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.74■■■■■ 7.15
NISCHQ9Y2I1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC59.73■■■■■ 7.15
NISCHQ9Y2I1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.72■■■■■ 7.15
NISCHQ9Y2I1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC59.72■■■■■ 7.15
NISCHQ9Y2I1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.72■■■■■ 7.15
NISCHQ9Y2I1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.72■■■■■ 7.15
NISCHQ9Y2I1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC59.72■■■■■ 7.15
NISCHQ9Y2I1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC59.71■■■■■ 7.15
NISCHQ9Y2I1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC59.71■■■■■ 7.15
NISCHQ9Y2I1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.7■■■■■ 7.15
NISCHQ9Y2I1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.7■■■■■ 7.15
NISCHQ9Y2I1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC59.69■■■■■ 7.15
NISCHQ9Y2I1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC59.69■■■■■ 7.15
NISCHQ9Y2I1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC59.68■■■■■ 7.14
NISCHQ9Y2I1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC59.68■■■■■ 7.14
NISCHQ9Y2I1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC59.68■■■■■ 7.14
NISCHQ9Y2I1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC59.67■■■■■ 7.14
NISCHQ9Y2I1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC59.67■■■■■ 7.14
NISCHQ9Y2I1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC59.64■■■■■ 7.14
NISCHQ9Y2I1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.63■■■■■ 7.14
NISCHQ9Y2I1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC59.61■■■■■ 7.13
NISCHQ9Y2I1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.6■■■■■ 7.13
NISCHQ9Y2I1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC59.6■■■■■ 7.13
NISCHQ9Y2I1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC59.59■■■■■ 7.13
NISCHQ9Y2I1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC59.59■■■■■ 7.13
NISCHQ9Y2I1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.59■■■■■ 7.13
NISCHQ9Y2I1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.58■■■■■ 7.13
NISCHQ9Y2I1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.58■■■■■ 7.13
NISCHQ9Y2I1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC59.57■■■■■ 7.13
NISCHQ9Y2I1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC59.57■■■■■ 7.13
NISCHQ9Y2I1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.56■■■■■ 7.13
NISCHQ9Y2I1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC59.56■■■■■ 7.12
NISCHQ9Y2I1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC59.55■■■■■ 7.12
NISCHQ9Y2I1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC59.53■■■■■ 7.12
NISCHQ9Y2I1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC59.53■■■■■ 7.12
NISCHQ9Y2I1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC59.52■■■■■ 7.12
NISCHQ9Y2I1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.52■■■■■ 7.12
NISCHQ9Y2I1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC59.51■■■■■ 7.12
NISCHQ9Y2I1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC59.51■■■■■ 7.12
NISCHQ9Y2I1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC59.51■■■■■ 7.12
NISCHQ9Y2I1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.5■■■■■ 7.12
NISCHQ9Y2I1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC59.5■■■■■ 7.11
NISCHQ9Y2I1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC59.49■■■■■ 7.11
NISCHQ9Y2I1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC59.49■■■■■ 7.11
NISCHQ9Y2I1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC59.49■■■■■ 7.11
NISCHQ9Y2I1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC59.49■■■■■ 7.11
NISCHQ9Y2I1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC59.48■■■■■ 7.11
NISCHQ9Y2I1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC59.48■■■■■ 7.11
NISCHQ9Y2I1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC59.47■■■■■ 7.11
NISCHQ9Y2I1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC59.47■■■■■ 7.11
NISCHQ9Y2I1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC59.46■■■■■ 7.11
NISCHQ9Y2I1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC59.45■■■■■ 7.11
NISCHQ9Y2I1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC59.44■■■■■ 7.11
NISCHQ9Y2I1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC59.44■■■■■ 7.11
NISCHQ9Y2I1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC59.44■■■■■ 7.11
NISCHQ9Y2I1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC59.43■■■■■ 7.1
NISCHQ9Y2I1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC59.43■■■■■ 7.1
NISCHQ9Y2I1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC59.42■■■■■ 7.1
NISCHQ9Y2I1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC59.42■■■■■ 7.1
NISCHQ9Y2I1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC59.42■■■■■ 7.1
NISCHQ9Y2I1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.42■■■■■ 7.1
NISCHQ9Y2I1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.41■■■■■ 7.1
NISCHQ9Y2I1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC59.41■■■■■ 7.1
NISCHQ9Y2I1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC59.41■■■■■ 7.1
NISCHQ9Y2I1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC59.4■■■■■ 7.1
NISCHQ9Y2I1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC59.39■■■■■ 7.1
NISCHQ9Y2I1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC59.39■■■■■ 7.1
NISCHQ9Y2I1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC59.39■■■■■ 7.1
NISCHQ9Y2I1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC59.38■■■■■ 7.1
NISCHQ9Y2I1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC59.38■■■■■ 7.1
NISCHQ9Y2I1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC59.37■■■■■ 7.09
NISCHQ9Y2I1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC59.37■■■■■ 7.09
NISCHQ9Y2I1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC59.36■■■■■ 7.09
NISCHQ9Y2I1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC59.36■■■■■ 7.09
NISCHQ9Y2I1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC59.36■■■■■ 7.09
NISCHQ9Y2I1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC59.36■■■■■ 7.09
NISCHQ9Y2I1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC59.36■■■■■ 7.09
NISCHQ9Y2I1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC59.35■■■■■ 7.09
NISCHQ9Y2I1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC59.35■■■■■ 7.09
NISCHQ9Y2I1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC59.35■■■■■ 7.09
NISCHQ9Y2I1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC59.34■■■■■ 7.09
NISCHQ9Y2I1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC59.34■■■■■ 7.09
NISCHQ9Y2I1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC59.34■■■■■ 7.09
NISCHQ9Y2I1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC59.32■■■■■ 7.09
NISCHQ9Y2I1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC59.32■■■■■ 7.09
NISCHQ9Y2I1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.32■■■■■ 7.09
NISCHQ9Y2I1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC59.31■■■■■ 7.09
NISCHQ9Y2I1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC59.3■■■■■ 7.08
NISCHQ9Y2I1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC59.3■■■■■ 7.08
NISCHQ9Y2I1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC59.29■■■■■ 7.08
NISCHQ9Y2I1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC59.29■■■■■ 7.08
NISCHQ9Y2I1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC59.29■■■■■ 7.08
NISCHQ9Y2I1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC59.28■■■■■ 7.08
NISCHQ9Y2I1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC59.28■■■■■ 7.08
NISCHQ9Y2I1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC59.27■■■■■ 7.08
NISCHQ9Y2I1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC59.27■■■■■ 7.08
NISCHQ9Y2I1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC59.27■■■■■ 7.08
NISCHQ9Y2I1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC59.25■■■■■ 7.08
NISCHQ9Y2I1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC59.25■■■■■ 7.08
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