Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
BTRCQ9Y297 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BTRCQ9Y297 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms