Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF3IP3Q9Y228 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF3IP3Q9Y228 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAF3IP3Q9Y228 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAF3IP3Q9Y228 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms