Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TTF2Q9UNY4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TTF2Q9UNY4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TTF2Q9UNY4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TTF2Q9UNY4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms