Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHA12Q9UN75 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHA12Q9UN75 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHA12Q9UN75 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
PCDHA12Q9UN75 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHA12Q9UN75 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms