Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO1Q9UM00 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO1Q9UM00 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO1Q9UM00 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMCO1Q9UM00 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms