Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV8

CBLC, E3 ubiquitin-protein ligase CBL-C, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLCQ9ULV8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBLCQ9ULV8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBLCQ9ULV8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBLCQ9ULV8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms