Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PLXNA1Q9UIW2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLXNA1Q9UIW2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLXNA1Q9UIW2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms