Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTI1BQ9UEU0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTI1BQ9UEU0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTI1BQ9UEU0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VTI1BQ9UEU0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms