Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COX16Q9P0S2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COX16Q9P0S2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COX16Q9P0S2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
COX16Q9P0S2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COX16Q9P0S2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COX16Q9P0S2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms