Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDAP2Q9NXN4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDAP2Q9NXN4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDAP2Q9NXN4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDAP2Q9NXN4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDAP2Q9NXN4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDAP2Q9NXN4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GDAP2Q9NXN4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDAP2Q9NXN4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDAP2Q9NXN4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDAP2Q9NXN4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDAP2Q9NXN4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDAP2Q9NXN4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDAP2Q9NXN4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDAP2Q9NXN4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDAP2Q9NXN4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDAP2Q9NXN4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDAP2Q9NXN4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDAP2Q9NXN4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDAP2Q9NXN4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GDAP2Q9NXN4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms