Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PGPEP1Q9NXJ5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PGPEP1Q9NXJ5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGPEP1Q9NXJ5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms