Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKS1Q9NXB0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKS1Q9NXB0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKS1Q9NXB0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MKS1Q9NXB0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms