Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM260Q9NX78 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM260Q9NX78 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM260Q9NX78 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM260Q9NX78 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM260Q9NX78 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM260Q9NX78 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM260Q9NX78 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TMEM260Q9NX78 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMEM260Q9NX78 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM260Q9NX78 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM260Q9NX78 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM260Q9NX78 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM260Q9NX78 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM260Q9NX78 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM260Q9NX78 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM260Q9NX78 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM260Q9NX78 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM260Q9NX78 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM260Q9NX78 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM260Q9NX78 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM260Q9NX78 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM260Q9NX78 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms