Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX15Q9NRS6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX15Q9NRS6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX15Q9NRS6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX15Q9NRS6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms