Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC2Q9NRP2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC2Q9NRP2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC2Q9NRP2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC2Q9NRP2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMC2Q9NRP2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMC2Q9NRP2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMC2Q9NRP2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMC2Q9NRP2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMC2Q9NRP2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMC2Q9NRP2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMC2Q9NRP2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMC2Q9NRP2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMC2Q9NRP2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMC2Q9NRP2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CMC2Q9NRP2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMC2Q9NRP2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CMC2Q9NRP2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms