Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMYD2Q9NRG4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD2Q9NRG4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD2Q9NRG4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD2Q9NRG4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMYD2Q9NRG4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD2Q9NRG4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMYD2Q9NRG4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD2Q9NRG4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD2Q9NRG4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD2Q9NRG4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD2Q9NRG4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD2Q9NRG4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD2Q9NRG4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD2Q9NRG4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD2Q9NRG4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD2Q9NRG4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms