Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y4

GPN2, GPN-loop GTPase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN2Q9H9Y4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPN2Q9H9Y4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPN2Q9H9Y4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPN2Q9H9Y4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPN2Q9H9Y4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPN2Q9H9Y4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPN2Q9H9Y4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPN2Q9H9Y4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPN2Q9H9Y4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPN2Q9H9Y4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPN2Q9H9Y4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPN2Q9H9Y4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPN2Q9H9Y4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPN2Q9H9Y4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPN2Q9H9Y4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPN2Q9H9Y4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPN2Q9H9Y4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPN2Q9H9Y4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.7 ms