Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4CQ9C0C4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA4CQ9C0C4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEMA4CQ9C0C4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4CQ9C0C4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms