Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
TM6SF1Q9BZW5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TM6SF1Q9BZW5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TM6SF1Q9BZW5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TM6SF1Q9BZW5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
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