Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFIH1Q9BYX4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IFIH1Q9BYX4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFIH1Q9BYX4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IFIH1Q9BYX4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFIH1Q9BYX4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFIH1Q9BYX4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFIH1Q9BYX4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFIH1Q9BYX4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFIH1Q9BYX4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFIH1Q9BYX4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFIH1Q9BYX4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFIH1Q9BYX4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFIH1Q9BYX4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFIH1Q9BYX4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFIH1Q9BYX4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IFIH1Q9BYX4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms