Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VN1R3Q9BXE9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VN1R3Q9BXE9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VN1R3Q9BXE9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
VN1R3Q9BXE9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VN1R3Q9BXE9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms