Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDFIP1Q9BT67 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDFIP1Q9BT67 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDFIP1Q9BT67 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms