Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL1Q99961 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GL1Q99961 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL1Q99961 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL1Q99961 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL1Q99961 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL1Q99961 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL1Q99961 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GL1Q99961 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH3GL1Q99961 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3GL1Q99961 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3GL1Q99961 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3GL1Q99961 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms