Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRRT1Q99946 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRRT1Q99946 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRRT1Q99946 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT1Q99946 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms