Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD180Q99467 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD180Q99467 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD180Q99467 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD180Q99467 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD180Q99467 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CD180Q99467 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD180Q99467 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD180Q99467 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD180Q99467 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD180Q99467 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD180Q99467 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD180Q99467 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD180Q99467 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD180Q99467 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD180Q99467 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD180Q99467 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD180Q99467 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD180Q99467 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CD180Q99467 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD180Q99467 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD180Q99467 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD180Q99467 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD180Q99467 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD180Q99467 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD180Q99467 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD180Q99467 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CD180Q99467 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD180Q99467 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD180Q99467 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD180Q99467 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD180Q99467 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD180Q99467 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD180Q99467 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CD180Q99467 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD180Q99467 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD180Q99467 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD180Q99467 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD180Q99467 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CD180Q99467 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD180Q99467 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD180Q99467 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD180Q99467 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD180Q99467 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CD180Q99467 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD180Q99467 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD180Q99467 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD180Q99467 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CD180Q99467 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CD180Q99467 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD180Q99467 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD180Q99467 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD180Q99467 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD180Q99467 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD180Q99467 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD180Q99467 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD180Q99467 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD180Q99467 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD180Q99467 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD180Q99467 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD180Q99467 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD180Q99467 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD180Q99467 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD180Q99467 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD180Q99467 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD180Q99467 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD180Q99467 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD180Q99467 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD180Q99467 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD180Q99467 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD180Q99467 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD180Q99467 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD180Q99467 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD180Q99467 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD180Q99467 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD180Q99467 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD180Q99467 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD180Q99467 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD180Q99467 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD180Q99467 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD180Q99467 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD180Q99467 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD180Q99467 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CD180Q99467 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD180Q99467 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD180Q99467 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD180Q99467 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD180Q99467 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD180Q99467 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD180Q99467 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CD180Q99467 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD180Q99467 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD180Q99467 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD180Q99467 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD180Q99467 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD180Q99467 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD180Q99467 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD180Q99467 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD180Q99467 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD180Q99467 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms