Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
RSF1Q96T23 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
RSF1Q96T23 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
RSF1Q96T23 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
RSF1Q96T23 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
RSF1Q96T23 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.7■■■■■ 4.91
RSF1Q96T23 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC45.7■■■■■ 4.91
RSF1Q96T23 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC45.69■■■■■ 4.91
RSF1Q96T23 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC45.69■■■■■ 4.91
RSF1Q96T23 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC45.69■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC45.68■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC45.66■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC45.66■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC45.65■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC45.64■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC45.64■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC45.64■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC45.63■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.63■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
RSF1Q96T23 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC45.62■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC45.6■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC45.6■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC45.57■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC45.57■■■■■ 4.89
RSF1Q96T23 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.88
RSF1Q96T23 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
RSF1Q96T23 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
RSF1Q96T23 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
RSF1Q96T23 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
RSF1Q96T23 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
RSF1Q96T23 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.52■■■■■ 4.88
RSF1Q96T23 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
RSF1Q96T23 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
RSF1Q96T23 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
RSF1Q96T23 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
RSF1Q96T23 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
RSF1Q96T23 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
RSF1Q96T23 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
RSF1Q96T23 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC45.51■■■■■ 4.88
RSF1Q96T23 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.88
RSF1Q96T23 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
RSF1Q96T23 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
RSF1Q96T23 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
RSF1Q96T23 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
RSF1Q96T23 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
RSF1Q96T23 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC45.44■■■■■ 4.87
RSF1Q96T23 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
RSF1Q96T23 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC45.44■■■■■ 4.86
RSF1Q96T23 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.86
RSF1Q96T23 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
RSF1Q96T23 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
RSF1Q96T23 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
RSF1Q96T23 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
RSF1Q96T23 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC45.42■■■■■ 4.86
RSF1Q96T23 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
RSF1Q96T23 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
RSF1Q96T23 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
RSF1Q96T23 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
RSF1Q96T23 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
RSF1Q96T23 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC45.38■■■■■ 4.86
RSF1Q96T23 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
RSF1Q96T23 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
RSF1Q96T23 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
RSF1Q96T23 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
RSF1Q96T23 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC45.35■■■■■ 4.85
RSF1Q96T23 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC45.35■■■■■ 4.85
RSF1Q96T23 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC45.35■■■■■ 4.85
RSF1Q96T23 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
RSF1Q96T23 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC45.35■■■■■ 4.85
RSF1Q96T23 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
RSF1Q96T23 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
RSF1Q96T23 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
RSF1Q96T23 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
RSF1Q96T23 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC45.32■■■■■ 4.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms