Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KC1Q96S38 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KC1Q96S38 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPS6KC1Q96S38 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KC1Q96S38 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms