Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAMD8Q96LT4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAMD8Q96LT4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD8Q96LT4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAMD8Q96LT4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms