Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCORQ96JN0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LCORQ96JN0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCORQ96JN0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCORQ96JN0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms