Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCMH1Q96GD3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCMH1Q96GD3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCMH1Q96GD3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms