Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHDC3Q96DC8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHDC3Q96DC8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHDC3Q96DC8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHDC3Q96DC8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHDC3Q96DC8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHDC3Q96DC8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHDC3Q96DC8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHDC3Q96DC8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHDC3Q96DC8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHDC3Q96DC8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHDC3Q96DC8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHDC3Q96DC8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHDC3Q96DC8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHDC3Q96DC8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECHDC3Q96DC8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECHDC3Q96DC8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECHDC3Q96DC8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECHDC3Q96DC8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHDC3Q96DC8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms