Protein–RNA interactions for Protein: Q96D96

HVCN1, Voltage-gated hydrogen channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HVCN1Q96D96 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HVCN1Q96D96 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HVCN1Q96D96 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HVCN1Q96D96 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HVCN1Q96D96 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HVCN1Q96D96 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HVCN1Q96D96 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HVCN1Q96D96 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HVCN1Q96D96 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HVCN1Q96D96 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HVCN1Q96D96 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HVCN1Q96D96 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HVCN1Q96D96 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HVCN1Q96D96 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HVCN1Q96D96 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HVCN1Q96D96 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HVCN1Q96D96 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HVCN1Q96D96 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms