Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPSB1Q96BD6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPSB1Q96BD6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPSB1Q96BD6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPSB1Q96BD6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms