Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC47Q96A33 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC47Q96A33 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC47Q96A33 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC47Q96A33 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC47Q96A33 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC47Q96A33 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC47Q96A33 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC47Q96A33 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC47Q96A33 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms