Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC44A1Q8WWI5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC44A1Q8WWI5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC44A1Q8WWI5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC44A1Q8WWI5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC44A1Q8WWI5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms