Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
U2AF1L4Q8WU68 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2AF1L4Q8WU68 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
U2AF1L4Q8WU68 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms