Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC44

RETREG2, Reticulophagy regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG2Q8NC44 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RETREG2Q8NC44 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RETREG2Q8NC44 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RETREG2Q8NC44 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RETREG2Q8NC44 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RETREG2Q8NC44 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RETREG2Q8NC44 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RETREG2Q8NC44 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RETREG2Q8NC44 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RETREG2Q8NC44 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RETREG2Q8NC44 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
RETREG2Q8NC44 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RETREG2Q8NC44 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms