Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARP9Q8IXQ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARP9Q8IXQ6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PARP9Q8IXQ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms