Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KSR1Q8IVT5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KSR1Q8IVT5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KSR1Q8IVT5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KSR1Q8IVT5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KSR1Q8IVT5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KSR1Q8IVT5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms