Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUF8

RIOX2, Ribosomal oxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX2Q8IUF8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIOX2Q8IUF8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIOX2Q8IUF8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIOX2Q8IUF8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIOX2Q8IUF8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIOX2Q8IUF8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RIOX2Q8IUF8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIOX2Q8IUF8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIOX2Q8IUF8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIOX2Q8IUF8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIOX2Q8IUF8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms