Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CTU1Q7Z7A3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CTU1Q7Z7A3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTU1Q7Z7A3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTU1Q7Z7A3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTU1Q7Z7A3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms